Пётр Егорович Кондратенко родился 1 января 1923 года в деревне Ожогино (ныне — Демидовский район Смоленской области).
Получил начальное образование, после чего работал в колхозе.
В 1940 году Кондратенко был призван на службу в Рабоче-крестьянскую Красную Армию.
С июня 1941 года — на фронтах Великой Отечественной войны. К июню 1944 года сержант Пётр Кондратенко был саперлм. Отличился во время форсирования Западнйо Двины.
В период с 23 по 26 июня 1944 года Кондратенко участвовал в форсировании Западной Двины в районе деревни Козоногово Шумилинского района, проделав 4 прохода во вражеских проволочных заграждениях и минных полях, лично снял 387 мин, подавил 1 огневую точку, уничтожил 21 немецкого солдата и офицера, ещё 24 взял в плен.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 июля 1944 года сержант Пётр Кондратенко был удостоен высокого звания Героя Советского Союза.
После окончания войны в звании старшего сержанта демобилизован. Проживал в Витебске.